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专家点评高歌团队发表单细胞多组学数据整合 [复制链接]

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李蕴(北卡罗来纳大学)、张金阳/赵方庆(中科院北京生命科学研究院)、袁国华(中科院上海营养健康所)/杨力(复旦大学)、张学工(清华大学)

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#生物信息学#

基因的转录在生物学中心法则中处于承上启下的重要环节,与相对“静态”的基因组相比,转录组在不同组织/器官/发育阶段均有显著变化,是细胞完成相应生理/病理功能的重要生物学基础。细胞是构成生命的基础单元,迅速发展的单细胞测序技术为在单细胞层面研究细胞功能及其背后的基因调控机制提供了重要的技术手段,单细胞测序可用于检测多种不同的组学种类,包括转录组、染色质开放组、DNA甲基化组、组蛋白修饰组等等,对不同组学技术产生的数据进行整合分析有助于更全面地刻画细胞内的基因调控状态、揭示调控机制。然而,与传统的bulk数据相比,单细胞数据具有规模大(百万级细胞)、噪声高(dropout,batcheffect)、异构性强等特点,如何通过开发新的计算方法实现对这些宝贵数据的有效利用已成为当今生物信息学领域

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