第二种方法，将人工改造的DNA注射入受精卵的前核中，用于产生转基因系，在此转基因系中人工改造的DNA被稳定整合到宿主基因组中(GordonandRuddle;Gossleretal.)。
这些策略已经广泛用于研究基因、细胞和整体动物的复杂生理系统的功能。然而，加工高容量载体的简便方法的发展一尤其是细菌人工染色体(BAC)一用于制备精确表达特定目的基因的转基因品系，使得转基因技术在各种各样的实验系统中得以普遍使用。
高容量载体的发展：优势和不足，
有时，用来自特定基因构建的小启动子载体可以获得精确的转基因表达。然而，近十年来，人们清楚地认识到，要想获得忠实于内源模式的基因表达，需要构建包含完整转录元件以及来自5和3-两侧外延调控域的大转基因载体。
事实上，人类基因组计划注释的蛋白质编码基因的平均大小是27kb(Venteretal.)，控制精确表达的调控元件可位于转录单位上游或下游数十乃至数百kb(千碱基)。
开发能携带数百kb基因组DNA的高容量载体，使得对精确表达重要的所有调控信息可以用于转基因实验。
人们首先报道在遗传拯救实验中采用了野生型基因组DNA的载体，大基因组载体指导精确转基因表达的能力得以展现(Schedletal.;Antochetal.)。但是，加工大DNA载体方法的发展，以及通过工程DNA获得精确的转基因表达的示范作用，
