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里程碑迄今最全跨组织细胞图谱绘成 [复制链接]

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人类细胞图谱(HCA)计划的目标是绘制出人体中的每种细胞类型,从而改变我们对生物学、感染和疾病的认识。美国《科学》杂志13日连发四篇论文,描述了国际HCA联盟研究人员已创建出人体33个器官和系统中超过一百万个细胞的高度详细的图谱。该图谱的完成为人类健康和疾病(包括免疫系统)提供了新的生物学见解,被认为是单细胞生物学领域取得的一个里程碑式的进步。

这些互补的多组织细胞图谱将有助于形成单一的人类细胞图谱,并具有许多治疗意义,或将帮助科学家重新认识常见和罕见疾病、疫苗开发、抗肿瘤免疫学和再生医学。这些图谱已开放获取,允许研究人员详细比较人体全身的特定细胞,揭示新的细胞功能。

深入研究跨组织的免疫系统

在《科学》合集的第一篇论文中,英国剑桥大学威康·桑格研究所研究人员及其合作者对来自12个成年器官捐赠者的16个组织中的个免疫细胞的RNA逐一进行了测序,以了解免疫细胞在不同组织中的功能。

在创建人体内免疫细胞的精选目录后,研究团队开发了一种机器学习工具CellTypist来自动识别细胞类型。使用该工具,他们确定了大约一百种不同类型的免疫细胞,包括特定的巨噬细胞、T细胞和B细胞,以及它们在不同组织中的分布。

HCA联盟委员会联合主席、威康桑格研究所细胞遗传学负责人萨拉·铁奇曼博士说:“通过HCA对细胞的详细了解,将有助于解释人类健康和疾病的方方面面。通过比较来自同一供体的多个组织中的特定免疫细胞,我们确定了身体不同区域中不同类型的记忆T细胞,这可能对控制感染产生重大影响。”

在《科学》合集的第二项研究中,桑格研究所研究人员和合作者创建了一个跨越9个器官的人类免疫系统发育图谱,揭示了参与血液和免疫细胞形成的组织,这将增强人们对免疫疾病的理解。它还揭示了随着人体生长而丢失的细胞类型,为体外细胞工程和再生医学研究提供了信息。

研究人员使用空间转录组学和单细胞RNA测序来绘制特定细胞在发育组织中的确切位置。研究人员识别出一种新型的B细胞,以及出现在生命早期阶段的独特T细胞。该团队使用来自其他人类细胞图谱研究的数据,证明了这些特定的免疫细胞并不会在成人体内发现。

冷冻组织的图谱揭示罕见和常见疾病基因

单细胞图谱的目标之一是绘制特定细胞类型,其中包括在整个人体中发挥作用的疾病基因,如导致肌肉萎缩症等罕见疾病或导致心脏病等常见疾病风险的基因。它需要对所有细胞类型进行分析,包括难以捕获的骨骼肌细胞、脂肪细胞和神经元。来自大量个体的细胞也很重要,需要科学家在分析前收集和冷冻组织。

在《科学》合集的第三项研究中,美国哈佛博德研究所研究人员及其合作者揭示了他们如何优化单核RNA测序以克服使用冷冻细胞带来的挑战,他们创建了一个跨组织图谱来分析来自多个冷冻储存组织的个细胞,重点

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