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TUhjnbcbe - 2023/7/18 21:08:00
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近日,华中农业大学生命科学技术学院严顺平课题组在NaturePlants发表了题为“AnovelWEE1pathwayforreplicationstressresponses”的研究论文,报道了蛋白激酶WEE1调控DNA复制胁迫应答的新机制。该研究不仅完善了WEE1信号通路,而且对利用WEE1抑制剂治疗癌症具有一定的指导意义。值得一提的是,严顺平教授作为通讯作者于年1月15日在NucleicAcidsResearch发表了另一篇相关论文,这两篇论文系统地阐述WEE1激酶调控DNA复制胁迫应答的分子机制(点击这里延伸阅读)。

研究背景

1.DNA复制是所有生物的基本过程。但是很多内源和外源的因素会影响DNA复制,造成DNA复制胁迫。生物体因此进化了精细的复制胁迫应答机制,以保证正确的DNA复制和基因组的稳定性。其中,激活细胞周期检测点是非常重要的机制之一,可以阻止细胞周期进程,使细胞有足够的时间解决复制问题。细胞周期蛋白依赖性激酶CDK是推动细胞周期进程的主要驱动蛋白,其活性会受到复制胁迫的抑制。

2.进化上保守的两个蛋白激酶ATR和WEE1在复制胁迫应答中起关键作用。在动物中,ATR可以激活细胞周期检测点激酶1(CHK1)。被激活的CHK1一方面可以抑制蛋白磷酸酶CDC25,另一方面可以促进WEE1。而CDC25通过去磷酸化CDK激活CDK,WEE1则通过磷酸化CDK抑制CDK。

3.植物具有ATR和WEE1,但是缺少CHK1和CDC25。而且在拟南芥中的研究表明,WEE1不是通过磷酸化CDKA;1(唯一的典型CDK)来发挥作用的。因此,ATR和WEE1在植物中的作用机理尚不清楚。

4.在动物中,突变ATR和WEE1会导致胚胎致死。而拟南芥atr和wee1突变体能正常生长,但是对复制胁迫诱导剂羟基尿(HU)非常敏感。在含有HU的培养基上生长时,atr突变体的主根比野生型显著缩短。这一表型为利用遗传学手段解析ATR的作用机理提供了便利。

主要研究结果

1.作者通过EMS诱变法筛选到一个atr突变体的抑制子soat1,能够抑制atr突变体对HU的敏感性。通过高通量测序和遗传互补实验发现突变基因为FBL17。由于他们发现ATR与FBL17之间没有相互作用,因此推测ATR可能通过WEE1间接地调控FBL17。他们发现突变FBL17确实也可以抑制wee1突变体对HU的敏感性,表明WEE1可能通过负调控FBL17来发挥作用。

图1突变FBL17抑制atr和wee1突变体对HU的敏感性

2.为了探究WEE1如何调控FBL17,作者测试了WEE1与FBL17之间的相互关系。通过Pull-Down实验、免疫共沉淀实验、BiFC实验以及荧光素酶互补实验,他们发现WEE1确实能够与FBL17直接相互作用。

3.鉴于WEE1是蛋白激酶,作者推测WEE1可以磷酸化FBL17。通过体内和体外磷酸化实验,他们发现WEE1能够磷酸化FBL17第99位的丝氨酸残基,而且HU处理会促进FBL17的磷酸化。

4.遗传学证据表明WEE1负调控FBL17,而以前的研究发现FBL17可以通过蛋白酶体途径被降解。因此,作者推测WEE1通过磷酸化FBL17促进其降解。通过泛素化实验和降解实验,作者发现WEE1介导的FBL17磷酸化是其被多聚泛素化和降解所必需的。通过转基因互补实验,他们发现非磷酸化形式的FBL17能够互补atrfbl17双突变体,而模拟磷酸化形式的FBL17则不能,暗示磷酸化形式的FBL17在体内会被降解。

5.以前的研究发现,FBL17通过介导CDK抑制蛋白(CKI)KRP6和KRP7的降解来控制生殖细胞的分裂。因此,作者推测FBL17也通过调控KRP6和KRP7来应答复制胁迫。为了验证这一点,他们在atr和wee1突变体中超量表达KRP6和KRP7,发现超量表达KRP7能抑制atr和wee1突变体对HU的敏感性。此外,他们还发现过量表达另一个CKI蛋白SMR7也可以抑制atr和wee1突变体对HU的敏感性。

6.在人细胞中,E3泛素连接酶SKP2和FBL17有很多相似之处。特别是,有研究发现突变SKP2可以减弱WEE1抑制剂导致的表型。因此,作者想知道人的WEE1是否也可以通过磷酸化负调控SKP2。通过免疫共沉淀实验和Pull-Down实验发现WEE1可以直接与SKP2相互作用。进一步通过体外磷酸化实验和降解实验发现WEE1能够磷酸化SKP2的第64位的丝氨酸残基,并促进其降解。

一图解文

图2WEE1-FBL17-CKI-CDK分子模块调控复制胁迫的工作模型

ATR被复制胁迫激活后会诱导WEE1的表达;作为蛋白激酶,WEE1磷酸化E3泛素连接酶FBL17;被磷酸化的FBL17会进一步被未知的E3泛素连接酶多聚泛素化,并通过26S蛋白酶体被降解;未磷酸化的FBL17促进CKI的多聚泛素化和降解。根据这个模型,在atr和wee1突变体中,FBL17不能被磷酸化,也不能被降解,从而导致CKI被降解;因此,当复制胁迫发生时,CDK仍能活跃地驱动细胞周期进程,细胞没有时间解决复制问题,最终导致复制灾难和严重的根系生长缺陷。在atrfbl17和wee1fbl17双突变体中,CKI不能被多聚泛素化和降解,从而抑制CDK和细胞周期进程,因此细胞有足够的时间解决复制问题,保证根系的正常生长。

研究意义

以前的研究表明,WEE1通过磷酸化CDK直接抑制CDK的活性。与直接抑制模型不同,该研究发现WEE1还可以通过E3泛素连接酶间接抑制CDK。这种间接调控机制在动物中是保守的,对利用WEE1抑制剂AZD治疗癌症具有一定的指导意义。该研究发现了WEE1的新底物FBL17,从而完善了植物的WEE1信号通路,加深了对复制胁迫应答机制的认识。该研究起始于模式植物拟南芥,最终发现了一个在动物和植物中保守的细胞周期调机制,进一步说明了模式植物研究的重要性和优越性。

主要作者介绍

华中农业大学生命科学学院博士后潘婷为本论文第一作者,严顺平教授为通讯作者。严顺平教授于年获浙江师范大学学士学位,年获中国科学院上海植物生理生态所博士学位,随后在美国杜克大学董欣年院士实验室开展博士后研究。年在华中农业大学生命科学技术学院组建实验室,致力于植物DNA损伤应答机理的研究,揭示了染色体结构维持复合体SMC5/6协同调控细胞周期和DNA损伤修复的机制(PNAS,),发现了ATR1-WEE1激酶模块通过抑制RNA剪接调控复合体MAC应答复制胁迫的机制(NucleicAcidsResearch,)。

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