原创作者:XiankunZhao
本文参考:ExPASyDatabase、ICLACDatabase、DSMZDatabase
导读
●CNE1、CNE2细胞株的建立,为我国鼻咽癌病因学研究、免疫学诊断及临床防治提供了良好的细胞实验模型。两者来源于不同个体:CNE1来源于一名女性高分化鳞癌患者;CNE2来源于一名男性低分化鳞癌患者。
(图片来源:ICLACDatabase)●但自年起,陆续有研究者发现这两株细胞株的STR分型结果呈现高度一致性,而且与HELA的STR数据具有较高相似度,此后又有多篇文献证实此发现。CNE1、CNE2被HELA污染,但并非完全来源于HELA,实为HELA与其他未知来源细胞的混合物。
来源
CNE1细胞株由中国医学科学院、中山医学院协作建立。年8月,细胞株从一名58岁女性鼻咽癌患者的鼻咽部肿物的活检组织建立。病人术前诊断为鼻咽癌,病理诊断为高分化鳞癌。组织块培养10天后,少数组织周边开始出现上皮样细胞。在第12代后,上皮样细胞中开始出现梭形细胞。此后选择全为上皮样细胞传代,称CNE(即CNE1)细胞株;全为梭形细胞传代,则称CNF细胞株。CNE1未检出EB病毒的核抗原(EBNA)。
CNE2细胞株由中国医学科学院、湛江医学院协作建立。年,细胞株从一名63岁男性鼻咽癌患者的活检组织建立。病理诊断为低分化鳞癌。接种一周后,上皮样细胞从组织块周边长出。接种两周后,开始出现纤维细胞,且生长占据优势,交替使用刮脱和胰酶的方法逐步去除纤维细胞。第四代开始细胞全部为上皮样细胞,且呈单层生长。第三代细胞EBNA检测呈阳性,但此后的传代细胞EBNA检测为阴性。
被HELA污染
年,SylviaYat-YeeChan等人的文章(PMID为)报道,CNE1与CNE2的STR分型结果高度一致。更重要的发现是,两者的分型数据与HELA具有相似性,他们将两株细胞株及HELA的分型数据进行对比分析,发现在检测的15个位点中,CNE1、CNE2在每个位点的数据都至少包含一个HELA的等位基因,即有些位点(vWA、D8S、D7S、CSF、D19S)并非与HELA基因型相同,仅含有HELA的一个等位基因。基于此发现,他们综合多种方法分析推测,CNE1、CNE2为HELA与其他未知来源细胞的混合物。
(图片来源:ExPASyDatabase)年,MichaelJ.Strong等人应用High-ThroughputRNASequencingAnalysis对包括CNE1、CNE2在内的多种鼻咽癌细胞株进行SNVs分析时发现,CNE1虽然被HELA污染,但并非完全来源于HELA。这也证实了SylviaYat-YeeChan等人的发现。
(图片来源:SylviaYat-YeeChanetal.,)年,FangYe等人同样对CNE1、CNE2进行STR分型,实验结果与SylviaYat-YeeChan的结论一致。年,YaqingHuang、XiaocuiBian的文章也证实这两株细胞株被HELA污染。
(图片来源:FangYeetal.,)(图片来源:YaqingHuangetal.,)鉴达CNE1与CNE2的鉴定
截止目前,鉴达受理CNE1、CNE2细胞株鉴定各有5株。与ExPASy、DSMZ数据库重新比对确认,
CNE1实际鉴定结果:4株与文献报道一致,为HELA与未知来源细胞的混合物,1株为非人源细胞。
CNE2实际鉴定结果:3株为HELA与未知来源细胞株的混合物品,1株为HELA,1株为无匹配结果。
鉴达实际检测结果显示,与ExPASy、ICLAC数据库一致,提示CNE1、CNE2被HELA污染。
参考文献:
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苏州鉴达采用STR分型技术,针对人源细胞20个位点进行检测,型、XL型遗传分析仪进行毛细管电泳,与DSMZ、Cellosaurus、ATCC等数据库进行比对,出具权威英文报告,为全国近家科研机构(高校、研究所、医院、公司)提供高质量服务,多家单位已利用鉴达细胞株鉴定服务在高水平期刊(如ClinicalCancerResearch、NatureCommnications、IntJCancer等)发表论文。
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