随着代谢组学的发展与应用，其相关技术和理论已被用于多个领域。尤其是农业领域，已经形成了一套完整的研究思路与体系。
小鹿这次来向大家介绍代谢组学在农业方向的应用及相关实验设计。代谢组在农业领域的主要应用可简要概括为三大类。（见下图）
第一类为生物标志物筛选：以动植物细胞组织为样本，比对农业生产中动植物重要差异性状代谢表征，找出潜在的生物标志物，用于农产品真假鉴定、风味或安全性检测及动植物疾病诊断等领域；
第二类为代谢机理研究：一般与其他组学包括基因组、转录组、蛋白组，表观组在内进行联合性分析，多用以探究样本代谢组变化的分子机制和遗传基础，为农业动植物的遗传育种提供借鉴；
第三大类为代谢流研究：结合数学建模手段对生物代谢网络进行挖掘分析，展现生物代谢的动态变化，用以定向改良提高作物生产力。具体案例如下。
一、生物标志物筛选
从生命中心法则来看，代谢位于生命活动调控的终端，是最接近表型的组学，更能直观反映机体被外界刺激或基因修饰后产生的响应变化。因此，将代谢物本身作为标志物，往往可以更直观地体现样本间差异。目前，利用代谢组检测生物标志物，已广泛用于农产品质检、病理分析及成分分析领域。
示例1
案例来源：《FoodChemistry》
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