原创作者:XiankunZhao
众所周知,PubPeer是一个鼓励同行匿名对已发表的学术论文进行评论的网站,评论内容可以是批评、质疑、改进建议等。从建立之初到现在,PubPeer已经成为揭露学术论文抄袭、剽窃、造假等学术不端问题的主要阵地。在PubPeer论文评论中,同行质疑细胞株身份的内容,近几年逐渐增加。
本次预警系列将为大家讲述上榜PubPeer的三株问题细胞--Changliver、U87、EAA,希望能帮助大家增加对这三株细胞株的认识、提示大家避免错用。目前,三株细胞在ExPASy数据库(Version40(December))中都已经明确标注为问题细胞。
Changliver
最初的Changliver于年从非恶性的人肝组织中获得,来源于肝窦内皮细胞。此后Changliver广泛应用于病毒学、生化和恶性肿瘤相关的转移研究。但在年,SMGartler发表文章指出,Changliver已被HELA污染;年有文献报道,Changliver的STR分型结果与HELA一致,进一步证实了SMGartler的观点。在各数据库中,不只ExPASy将Changliver标注为问题细胞,ICLAC也将其列入“TheRegisterofCross-Contaminated/MisidentifiedCellLines”,而DSMZ则更为直接地对其命名为“HeLa[ChangLiver]”。
(图片来源:JRMastersetal.,)
(图片来源:ExPASy)
而在“打假网站”PubPeer上,年7月份,有人对投稿在JPharmPharmacol.的一篇文章就实验使用Changliver提出评论。评论人直接质疑Changliver的细胞身份,以及文章数据、结论的可靠性。
(图片来源:PubPeer)
U87
人胶质母细胞瘤细胞株U87最初是由瑞典乌普萨拉(Uppsala)大学在年建立的,源于恶性神经胶质瘤。作为当年参与乌普萨拉大学构建U87细胞株的一名科学家,BengtWestermark及其团队在年发表文章指出,从ATCC购买到的U87细胞株与乌普萨拉大学当初建立的U87细胞株的STR分型完全不同,证实U87ATCC并非来源于U87Uppsala。虽然前者同样是人胶质母细胞瘤细胞,但其来源未知。目前,在科研圈广泛使用的商品化U87恰恰为U87ATCC,最初的U87Uppsala已经被污染。
(图片来源:MarieAllenetal.,)
(图片来源:ExPASy)
年,有人在PubPeer上对PLoSONE.的一篇文章提出异议,其中就包括实验所用的U87的细胞身份问题。很快,作者就进行了回复,说明所用U87确为U87ATCC,而非最初的人胶质母细胞瘤细胞株U87Uppsala。
(图片来源:PubPeer)
EAA
EAA细胞株是由美国路易斯安那州立大学健康科学中心ShahriarKoochekpour团队建立,并于年7月在TheProstate.发表文章。细胞株来源于一名50岁非洲裔的临床局限性前列腺癌患者,ShahriarKoochekpour等人对病人进行耻骨后根治性前列腺切除术时,获得培养细胞的癌组织。EAA呈现雄激素依赖性生长特性;虽是肿瘤细胞株,但在裸鼠中未发现EAA具有致瘤性。
年,ShahriarKoochekpour团队在TheProstate.发表了一篇关于年7月发表的那篇文章的论文勘误,说明了EAA实质为来源于一男性白人的肾腺癌细胞株O的亚克隆,其被污染原因可能是EAA早期传代培养时与O混淆。
(图片来源:SKoochekpouretal.,)
(图片来源:ExPASy)
根据这篇论文勘误,有人在PubPeer上也指出,ShahriarKoochekpour团队于年在IntJBiolSci.发表的《EstablishmentandcharacterizationofahighlytumorigenicAfricanAmericanprostatecancercellline,EAA-hT》也是有问题的。因为EAA-hT是EAA的子系,自然它也被O污染了。
(图片来源:PubPeer)
参考文献:
1.ApparentHelacellcontaminationofhumanheteroploidcelllines.Nature.Feb24;():-1.
2.Shorttandemrepeatprofilingprovidesaninternationalreferencestandardforhumancelllines.ProcNatlAcadSciUSA.Jul3;98(14):-7.
3.Longtermcultureofnormalandneoplastichumanglia.ActaPatholMicrobiolScand.;74(4):-86.
4.OriginoftheU87MGgliomacellline:Goodnewsandbadnews.SciTranslMed.Aug31;8():re3.
5.Establishmentandcharacterizationofaprimaryandrogen-responsiveAfrican-Americanprostatecancercellline,EAA.Prostate.Jul1;60(2):-52.
6.Correction:EstablishmentandcharacterizationofaprimaryandrogenresponsiveAfricanAmericanprostatecancercellline,EAA.Prostate;60(2):.Prostate.May;79(7):.
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