AID是指机体免疫系统对自身抗原发生免疫应答反应造成持久性器官损伤的一大类疾病，包含70余种疾病。其发病率高，全球有7.6%～9.4%的人群患有各种类型的AID。
通常难以治愈、致残率高，部分难治患者常规治疗效果差、甚至无效。因此，积极探索更有效的治疗手段对难治性AID患者具有重要意义。
近年来，随着对再生医学的深入研究，发现自体造血干细胞移植（auto-HSCT）为难治AID患者带来了有效、安全的治疗选择，改善了生活质量，是唯一能够使难治性AID患者达到长期缓解且不需要药物维持的治疗方法，在AID中的应用已成为近年来研究热点。
自体造血干细胞移植治疗AID机制
异常免疫细胞清除
移植前预处理可将机体内的异常免疫细胞如自身反应性T淋巴细胞，记忆性T、B淋巴细胞大部分清除从而减轻或终止了靶器官的再损伤。
另外，移植后机体的免疫抑制状态可持续1年之久，表现为CD4+T细胞减少，CD4+/CD8+比例倒置，自身抗体产生的减少，有利于免疫损伤组织修复。
免疫系统重建
免疫耐受失衡会导致AID。无论抗体还是T细胞介导的AID主要由CD4+T细胞驱动。辅助性T细胞17（Th17）和调节性T细胞（Treg）是由CD4+T细胞分化而来，Th17/Treg细胞失衡与多种AID相关。其中Treg细胞具有免疫调节作用，在免疫稳态和诱导免疫耐受中发挥重要作用。
研究显示，auto-HSCT可通过重建CD4+T细胞群，尤其是Terg细胞群使免疫系统恢复稳态，并通过恢复T细胞受体多样性和功能来重建新的免疫系统，免疫重建过程中因胸腺的修饰作用（阳性选择、阴性选择），诱导机体对自身抗原重新耐受，达到免疫时钟的重新设定作用。
因此，auto-HSCT治疗AID患者可能是通过移植前异常免疫细胞的清除、移植后长期免疫抑制及免疫系统重建起作用的。
基础研究
在关节炎小鼠模型中，auto-HSCT后Treg细胞的减少会导致疾病活动。这些证据均表明，Treg细胞对免疫稳态的维持和疾病的长期缓解至关重要，auto-HSCT可能通过Treg细胞重建免疫系统。
auto-HSCT治疗各AID进展
临床研究
近年来应用auto-HSCT治疗难治AID在国内外受到广泛